Biaya pendidikan MPPDAS menggunakan sistem Uang Kuliah Tunggal (UKT) sebesar Rp. 9.000.000,- (Sembilan juta rupiah) per semester.

Program MPPDAS menawarkan bantuan pendidikan selama 2 semester bagi mahasiswa baru (dalam kuota terbatas) yang memiliki Indeks Prestasi akademis S1 di atas 3,5 dengan nilai toefl minimal 500.

Selain itu, terdapat berbagai penawaran beasiswa, diantaranya dari Kementerian Pendidikan dan Kebudayaan melalui program Beasiswa Unggulan, Kementerian Keuangan melalui Lembaga Pengelola Dana Pendidikan (LPDP), serta dari beberapa lembaga pemerintah dan swasta lainnya.

MPPDAS menawarkan program kerjasama dengan pemerintah baik pemda, badan, maupun kementerian untuk menerima putra daerah dan pegawai pemerintah yang memenuhi syarat program magister.